Analyse des modifications transcriptomiques et épigénétiques durant la différenciation des cellules pancréatiques

Abstract

Une compréhension précise et détaillée des événements morphologiques et moléculaires gouvernant le développement du pancréas a un impact sur la médecine clinique liée notamment au diabète, à l'obésité et au cancer du pancréas. Le poisson-zèbre (Danio rerio) est rapidement devenu un spécimen populaire pour étudier et décrire le développement des vertébrés, offrant ainsi un nouveau modèle d'investigation. Le but poursuivi par ce mémoire est de comparer le transcriptome des cellules progénitrices pancréatiques afin d’identifier les gènes ayant conservé une expression enrichie dans ces cellules durant l’évolution des vertébrés. En effet, une expression génique conservée est l’indication d’une fonction génique maintenue durant l’évolution et ceci témoigne d’un rôle crucial imputé au gène. La comparaison est réalisée entre trois espèces : le poisson-zèbre, la souris et l’homme. L’étude a permis de mettre en évidence des gènes enrichis dans les progéniteurs pancréatiques. Au sein de ces gènes, de nombreux facteurs de transcription identifiés comme étant déterminants dans la différenciation des cellules pancréatiques sont présents (Pdx1, Ptf1a, Pax4, Arxa, Pcsk1, Gria2b… ). D’autres gènes répertoriés sont des candidats intéressants pour des études ultérieures, notamment Zfhx3 ayant un niveau d’expression relativement élevé.